Çanakkale Tarihi Alan Başkanlığı tarafından yürütülen Seddülbahir Kalesi ve çevresinin yeniden işlevlendirme projesinde temel yaklaşım, Kale’nin ve çevresinin bütünsel olarak ele alınması oldu. Kale’nin bir müze olarak işlevlendirilmesindeki önceliğimiz ise mimari mirasın korunmasıydı. Devam eden kazılarda ortaya çıkan arkeolojik buluntular, Çanakkale’nin doğal mirası, Seddülbahir Kalesi’nin savaş arkeolojisi içindeki özel hikâyesi, 1996 yılından bugüne kadar devam eden kazılar ve restorasyon süreci müze anlatımında ziyaretçiye sunuluyor.